Paprskoploutvé ryby jsou největší skupinou ryb, jejich vývoj je datován od spodního devonu, zhruba před 390 milióny lety.
Podle Nelsona, 2006, se dělí do 3 podtříd, kam patří celkem 44 řádů, 453 čeledí, 4289 rodů a 26 891 druhů. Zhruba 44 % druhů je sladkovodních, ostatní druhy žijí v mořích a oceánech.
Třída Actinopterygii se dělí do tří podtříd:
Systém kostnatých ryb začíná dvěma řády, s nimiž si, zjednodušeně řečeno, neví zatím systematikové rady, a proto je nezařazují do žádného vyššího taxonu - jsou to kostlíni (Lepisosteiformes) a kaprouni (Amiiformes). Všechny ostatní kostnaté ryby tvoří jednu monofyletickou sekci Teleostei, která se dělí na čtyři podsekce a ty pak dále na jednotlivé řády a čeledi.